Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms