Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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