Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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