Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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