Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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