Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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NUP160Q12769 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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NUP160Q12769 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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NUP160Q12769 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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NUP160Q12769 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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