Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms