Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK18Q07002 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK18Q07002 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK18Q07002 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.7 ms