Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms