Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms