Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms