Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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