Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms