Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CDKN1BP46527 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms