Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP13P45452 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms