Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGAEP38570 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms