Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms