Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA10P31260 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms