Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARID4AP29374 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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