Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PLNP26678 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PLNP26678 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms