Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTSSP25774 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CTSSP25774 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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