Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLDCP23378 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms