Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms