Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DESP17661 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DESP17661 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms