Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms