Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM228BP0C875 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms