Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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