Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCGP05129 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCGP05129 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKCGP05129 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms