Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PPFIA3O75145 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms