Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRKAB2O43741 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms