Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSI1O43347 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSI1O43347 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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