Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF839A8K0R7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms