Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWA8A3KMH1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms