Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD54BQ9Y620 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms