Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAK1Q9UPV9 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms