Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms