Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HDAC6Q9UBN7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDAC6Q9UBN7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms