Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms