Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC180Q9P1Z9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms