Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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