Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ELL3Q9HB65 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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