Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms