Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2AFJQ9BTM1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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