Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KCNS3Q9BQ31 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms