Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGAM5Q96HS1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms