Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYFIP2Q96F07 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms