Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNFT2Q96EX2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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