Protein–RNA interactions for Protein: Q92538

GBF1, Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBF1Q92538 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBF1Q92538 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms