Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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USP43Q70EL4 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP43Q70EL4 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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