Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCD1Q6ZMY3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 531.1 ms